Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
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Ebf1Q07802 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ebf1Q07802 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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