Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NcanP55066 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NcanP55066 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcanP55066 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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