Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SftpbP50405 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms