Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxc11P31313 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Hoxc11P31313 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxc11P31313 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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