Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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Vpreb1P13372 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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Vpreb1P13372 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Vpreb1P13372 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Vpreb1P13372 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Vpreb1P13372 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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