Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ifnb1P01575 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ifnb1P01575 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ifnb1P01575 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ifnb1P01575 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ifnb1P01575 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ifnb1P01575 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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