Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms