Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm21060J3KMU4 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms