Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Rnf4Q9QZS2 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rnf4Q9QZS2 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
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