Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm7424-201ENSMUST00000206919 902 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Higd1aQ9JLR9 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms