Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms