Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Upk3aQ9JKX8 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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