Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Ercc8Q8CFD5 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Ercc8Q8CFD5 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Ercc8Q8CFD5 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Ercc8Q8CFD5 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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Ercc8Q8CFD5 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Ercc8Q8CFD5 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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Ercc8Q8CFD5 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Ercc8Q8CFD5 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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