Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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Dsg1bQ7TSF1 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Dsg1bQ7TSF1 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Dsg1bQ7TSF1 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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Dsg1bQ7TSF1 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Dsg1bQ7TSF1 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Dsg1bQ7TSF1 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Dsg1bQ7TSF1 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms