Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Nbr1-201ENSMUST00000071537 3239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Adam1a-201ENSMUST00000100757 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr557-202ENSMUST00000215423 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Cnksr3-202ENSMUST00000150282 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Hmgcs1-202ENSMUST00000224188 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10472-201ENSMUST00000193014 2102 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Rint1-201ENSMUST00000030852 3298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv11-1-201ENSMUST00000103466 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Elof1-205ENSMUST00000216837 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Gpx2-201ENSMUST00000082431 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Thbs3-201ENSMUST00000029682 3190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Mapk6-201ENSMUST00000049355 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm12263-201ENSMUST00000119105 1482 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 5730455P16Rik-201ENSMUST00000103225 4554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Clec4f-201ENSMUST00000014686 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gtpbp6Q3U6U5 Bcas1-201ENSMUST00000013667 2916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43756-201ENSMUST00000199788 2838 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ces2c-201ENSMUST00000055052 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19127-201ENSMUST00000207067 2445 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Top3a-203ENSMUST00000117743 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25767-201ENSMUST00000158572 124 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23823-201ENSMUST00000158740 124 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gtpbp6Q3U6U5 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms