Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms