Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Hoxd10P28359 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxd10P28359 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
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