Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Ggta1P23336 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms