Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P10404 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
P10404 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms