Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Ccl20O89093 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl20O89093 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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