Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 B020018J22Rik-201ENSMUST00000223085 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Zmat3-203ENSMUST00000168566 7672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Col19a1-201ENSMUST00000051344 3336 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Slc30a2-202ENSMUST00000105872 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Sars-201ENSMUST00000090553 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Zscan22-202ENSMUST00000117189 2995 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 4930543N07Rik-201ENSMUST00000209357 1364 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Zfp940-201ENSMUST00000085792 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 D830044D21Rik-201ENSMUST00000143315 3897 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm43414-201ENSMUST00000197710 3188 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Sltm-201ENSMUST00000049263 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Slc4a2-203ENSMUST00000115049 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm28447-202ENSMUST00000186677 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 2610008E11Rik-201ENSMUST00000039271 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Trav9n-4-201ENSMUST00000103626 595 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Rpl37rt-202ENSMUST00000124641 294 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm16159-201ENSMUST00000126122 947 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Olfr1331-201ENSMUST00000094831 954 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Defa29-201ENSMUST00000098890 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm35608-201ENSMUST00000218472 2370 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Ccdc116-201ENSMUST00000023452 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Epn2-202ENSMUST00000108711 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Egflam-202ENSMUST00000096494 4391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Rbm25-201ENSMUST00000048155 4226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Sox6-203ENSMUST00000166207 2825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Zfp260-201ENSMUST00000050735 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gramd4-201ENSMUST00000088931 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Zfp354a-203ENSMUST00000109119 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Ttc5-202ENSMUST00000226768 2366 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Cth-201ENSMUST00000118539 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Cenpi-202ENSMUST00000101251 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Foxp4Q9DBY0 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms