Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc97Q9DBT3 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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