Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rprd1aQ8VDS4 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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