Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Trappc12Q8K2L8 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms