Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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SbsnQ8CIT9 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SbsnQ8CIT9 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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