Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Snx8Q8CFD4 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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