Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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