Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Usp19Q3UJD6 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Usp19Q3UJD6 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms