Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Rpusd3Q14AI6 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Rpusd3Q14AI6 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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