Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Ptger2-201ENSMUST00000046891 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Npnt-201ENSMUST00000042729 3601 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm28945-201ENSMUST00000187780 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpusd2Q149F1 Gm29622-201ENSMUST00000190914 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms