Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Cntn3Q07409 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms