Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Sh3bp1P55194 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Sh3bp1P55194 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.2 ms