Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Usp4P35123 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms