Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxraP28700 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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