Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Rrn3B2RS91 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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