Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Col5a3Q9JLI2 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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