Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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OtofQ9ESF1 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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OtofQ9ESF1 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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OtofQ9ESF1 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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OtofQ9ESF1 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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OtofQ9ESF1 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7□□□□□ -1.29
OtofQ9ESF1 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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