Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Rnft1Q9DCN7 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rnft1Q9DCN7 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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