Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Rnf6Q9DBU5 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnf6Q9DBU5 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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