Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf17Q99MV7 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rnf17Q99MV7 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rnf17Q99MV7 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rnf17Q99MV7 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rnf17Q99MV7 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rnf17Q99MV7 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rnf17Q99MV7 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rnf17Q99MV7 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf17Q99MV7 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf17Q99MV7 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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