Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Csmd1Q923L3 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms