Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp27Q8CEG8 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp27Q8CEG8 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms