Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trim17Q7TPM3 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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