Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm29577-201ENSMUST00000186427 693 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Lrrc66-201ENSMUST00000087177 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm13633-201ENSMUST00000120668 898 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Clcn1Q64347 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms