Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxa13Q62424 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms