Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec31aQ3UPL0 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec31aQ3UPL0 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms