Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Usp39Q3TIX9 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Usp39Q3TIX9 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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