Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Chd1P40201 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Chd1P40201 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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