Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpcP21841 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms