Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P18526 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P18526 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
P18526 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms